Основными направлениями работы Отдела являются:

• организация пастырского руководства, воспитания военнослужащих и членов их семей;
• организация православных библиотек и видеотек в воинских частях, подразделениях и других учреждениях;
• организация культурно-массовых мероприятий в дни особо чтимых православных и государственных праздников;
• организация и проведение ежегодных научно-практических конференций, посвящённых взаимодействию Церкви и силовых структур.

Отдел взаимодействует со следующими организациями и структурами:

• Управлением пограничной службы ФСБ России по Ярославской области;
• войсковой частью №74400 города Переславля-Залесского;
• учебным центром войсковой части №9804 Борисоглебского района;
• администрациями городов и районов, расположенных на территории Переславской епархии;
• Московским пограничным институтом ФСБ России;
• Голицинским пограничным институтом ФСБ России;
• органами внутренних дел, МЧС, пожарных частей, Госавтоинспекций, вневедомственной охраны городов и районов, расположенных на территории Переславской епархии.