Годеново — древнее село, расположенное на территории Ростовского района Ярославской области. Известно, что в XVI в. оно принадлежало ростовскому князю Борису Андреевичу Приимкову, происходившему из рода Рюриковичей. Внук его, Иван Никитич Приимков-Ростовский, пожертвовал вотчину «на помин своей души» Ростовскому архиерейскому дому. Впоследствии, в XVIII в., Годеново перешло в ведомство Коллегии экономии.

Согласно архивным документам и библиографическим источникам, каменная пятиглавая церковь во имя свт. Иоанна Златоуста с шатровой колокольней возведена вместо одноименного деревянного храма в 1784–1794 гг. на средства приходских людей. На 1784 г. в приходе церкви свт. Иоанна Златоуста числилось: «приходских 150 дворов, в них душ мужеска 454, женска 476. Обоего 930. Священно и церковнослужителей в том селе имеется: священник, диакон, дьячок и пономарь». Строительство нового каменного храма продолжалось 10 лет — до 1794 г.

Согласно документальным источникам, в 1844–1847 гг. на средства приходских людей к зданию церкви свт. Иоанна Златоуста с северной стороны пристраивается тёплый придел во имя Боголюбской иконы Божией Матери.

В 1890 г. вступил в должность церковный староста крестьянин Карашской волости дер. Баскача Иван Порфирьев Кожин. Благодаря его активной деятельности, в 1890–1896 гг. в церкви свт. Иоанна Златоуста были проведены значительные строительные и ремонтные работы: увеличена площадь придела во имя Боголюбской иконы Божией Матери, устроены каменная паперть холодной церкви и каменный тамбур тёплой церкви.

На основании архивных материалов можно точно датировать изменения, произошедшие в храме: в 1892 г. Боголюбская церковь была украшена настенными росписями, в 1893 г. в ней позолочен иконостас, а в 1895 г. устроен чугунный пол. В 1896 г. позолочены паникадила.

Важным обстоятельством в характеристике социальной культуры прихода является то, что со времени построения каменного храма до 1922 г. службу в нём совершали последовательно всего пять священников.

При священнике Михаиле Яковлеве, начавшем своё служение в одноимённой деревянной церкви, в 1784 г. начали строить каменный храм.

В 1790 г. его сменил священник Федор Козмин, служение которого продолжалось до 14 июня 1828 г.

Почти столетие связано с родом священников Апеллесовых. «Пономарский сын» Василий Никифоров Апеллесов был рукоположен во священники церкви Иоанна Златоуста в с. Годеново 29 июля 1823 г., после успешного окончания Владимирской духовной семинарии. В течение 44 лет он окормлял его паству. За эти годы был отстроен тёплый придел, благоукрашен интерьер церкви.

Его сын, Александр Васильевич Апеллесов, после окончания Ярославской духовной семинарии был рукоположен во священники церкви свт. Иоанна Златоуста 8 июня 1867 г. и прослужил здесь более полувека. В 1919 г., будучи 76-летним старцем, протоиерей Александр продолжал отстаивать интересы своего прихода, численность которого составляла более 2 000 человек. В 1922 г. был арестован по обвинению в сопротивлении изъятию церковных ценностей.

В 1922 г. в Годеново был назначен священник Алексей Александрович Голосов, который совершал богослужение в храме Иоанна Златоуста до своего ареста в 1930 г. по обвинению в агитации крестьян против вступления в колхоз. Несмотря на арест настоятеля, храм в этот период оставался действующим.

В конце 1930-х — начале 1940-х гг. в истории храма произошло знаменательное событие: сюда был перенесён из закрытого в феврале 1940 г. Крестовоздвиженского храма Никольского погоста, что у Иисусова Креста, Животворящий Крест Господень — почитаемая святыня, явление которой произошло в XV в. В окрестностях Годеново. По преданию явление Креста Господня верующим произошло на месте, где ранее было Сахотское болото. Чудо свершилось 29 мая 1423 г., поблизости с Никольским кладбищем.

В советское время в храме Иоанна Златоуста продолжались богослужения, ненадолго прервавшиеся в конце 1930-х — начале 1940-х гг.

Согласно воспоминаниям местных жителей с. Годеново и дер. Захарово, церковь хоть и была закрыта в эти годы, но ключи от неё находились у прихожан, имевших тем самым возможность молиться в храме.

С 1997 г. по инициативе Переславль-Залесского Никольского женского монастыря в церкви свт. Иоанна Златоуста начались ремонтно-реставрационные работы: реставрация кирпичной кладки стен, ремонт глав и кровли, устройство отопления, установка столярных заполнений дверных и оконных проёмов, устройство полов в летнем и зимнем храме, устройство гидроизоляции. В 2005–2009 гг. произведена реставрация иконостасов, станковой и настенной живописи; в 2002–2003 гг. выполнена комплексная научная реставрация «Животворящего Креста Господня». Ремонт церковной ограды со Святыми воротами осуществлен в 2011–2012 гг. Благоустройство территории выполнено в 2014–2015 гг.

С 1999 г. по настоящее время церковь свт. Иоанна Златоуста в с. Годеново является подворьем Никольского женского монастыря г. Переславля-Залесского.

Церковь во имя свт. Иоанна Златоуста представляет собой характерный для местной архитектуры приходской храм, следующий традициям, сложившимся к последней четверти XVIII в. Композиция храма выстроена линейно, ориентирована по оси восток-запад. Главным объёмом является двусветный четверик, завершённый четырехскатной крышей с пятью главами: центральный барабан световой, боковые — глухие, разнесённые на самые углы. Храм имеет богатый архитектурный декор в традициях XVII в.

Архитектурно-художественное оформление интерьера основного храма в целом сохранило свои подлинные исторические формы.

Согласно храмовой летописи, сохранившейся на западной стене трапезной, настенная живопись выполнена масляными красками в 1859 г. живописцем Алексеем Глебовым, поновлена в 1900–1903 гг. Василием Кузнецовым и Николаем Морокуевым.

Исторический интерьер придела частично утрачен: не сохранилась монументальная живопись, придельный иконостас воссоздан в прежних формах в 2000-е гг.