В 18 километрах от Ростова Великого находится посёлок Борисоглебский. Главной достопримечательностью его является монастырь, основанный в честь первых русских святых благоверных князей Бориса и Глеба. Сам преподобный Сергий Радонежский благословил в 1363 году на создание монастыря новгородских монахов Феодора и Павла.

Историческое предание сообщает о том, что преподобный Сергий Радонежский выбрал место для строительства нового общежитийного монастыря, предсказав его дальнейшее процветание. Основатели монастыря прославлены как преподобные и входят в Собор Ростово-Ярославских святых. Их мощи и погребальная рака находятся в северо-западном углу Борисоглебского собора и являются местом почитания этих святых.

Все строения в монастыре были деревянными. Таковым он просуществовал 159 лет.

Борисоглебский монастырь был любим московскими князьями и первыми русскими царями, считавшими его своим «домашним». Во время междоусобной войны середины XV века в стенах Борисоглебской обители находил приют великий князь Василий II Тёмный. В 1440 году Борисоглебский игумен Питирим крестил в стенах монастыря первого русского царя Ивана III, сына Василия Тёмного. Как и отец, Иван III всю жизнь жаловал «домашний» монастырь деньгами и вотчинами. При сыне Ивана III, Василии III, в 1522 году в Борисоглебском монастыре начинается каменное строительство. Для этой цели в обитель был направлен великого князя мастер «каменный здатель» Григорий Борисов. В монастыре налажено производство кирпича, из округи свозятся валуны для фундаментов, добывается песок, чудесным образом обретается известь. Трижды посещал Борисоглебскую обитель Иван IV Грозный, причём первый раз ещё юношей в 1545 году. Иван Грозный сделал более 20 вкладов в Борисоглебский монастырь: книги, огромные денежные вклады и колокол весом в 138 пудов. Вклады в Борисоглебский монастырь делали также цари Борис Годунов, Алексей Михайлович, князья Сабуровы, Пивовы, Бельские, Шуйские, Пронские, Орловы, Сумароковы и другие. К середине XVII века Борисоглебский монастырь владел 22 тысячами десятин земли и 4-мя подведомственными монастырями: Троицким на Бору, Никольским на Ковже, Спасской пустынью и Никольским на Бою. Он по праву считался одним из богатейших в Ростовской митрополии.

Очень известен был Борисоглебский монастырь в начале XVII века, когда в его стенах подвизался затворник преподобный Иринарх (1548-1616). Иринарх прославил обитель своим духовным подвигом, взяв на себя высшую степень монашеского жития — затвор, прожив в веригах 38 лет. Именно он предсказал царю Василию Шуйскому «пленение Руси поляками». В стенах Борисоглебского монастыря побывали полководцы: князья Борис Лыков-Оболенский, Михаил Скопин-Шуйский, Дмитрий Пожарский и Кузьма Минин, видевшие в преподобном Иринархе духовного наставника.

Одновременно со строительством Ростовского кремля в конце XVII века, по указанию Ростовского митрополита Ионы Сысоевича, на территории Борисоглебского монастыря начинаются масштабные строительные работы: перестраиваются уже существующие здания и возводятся новые. Проведённые Петром I и Екатериной II секуляризации церковных доходов и земель, введение монастырских штатов, сделали Борисоглебскую обитель заурядным второклассным монастырём. Источником существования монастыря в XVIII-XIX веках были 280 десятин земли, сад с восьмилучевой планировкой и доходы от сдачи в аренду башен и монастырских торговых лавок за крепостными стенами. Из царствующих особ в Борисоглебском монастыре побывали лишь Екатерина II и Александр III, да и то проездом из Углича в Ростов, совершая паломничество по святым местам.

Монастырь стал крупным духовным и экономическим центром, вокруг которого возникли Борисоглебские слободы — крупное торговое село Ростовского уезда Ярославской губернии, центр Борисоглебской волости. В 1764 году слободы из владения монастыря были переданы Екатериной II своему фавориту графу Алексею Орлову. В праздник Бориса и Глеба у стен монастыря традиционно проходила богатая ярмарка.

Ежегодно перед праздником пророка Ильи совершается крестный ход из стен обители к источнику преподобного Иринарха, в 40 километрах от монастыря, что близ села Кондакова — родины святого. В 1998 году архиепископ Ярославский и Ростовский Михей (Хархаров) благословил возобновить традицию пеших крестных ходов к источнику преподобного Иринарха. Участники по очереди одевают на себя вериги преподобного, в конце все купаются в источнике. Крестный ход начинается архиерейской Литургией в Борисоглебском монастыре.

Среди церковных деятелей, подвизавшихся в Ростовском Борисоглебском монастыре, — архиепископ Ростовский и Ярославский Тихон (Малышкин). Настоятелем монастыря некоторое время являлся известный археограф и палеограф, собиратель и исследователь памятников древнерусской письменности архимандрит Амфилохий (Казанский), будущий епископ Угличский.

В 1924 году монастырь был официально упразднен. В советский период в зданиях монастыря были размещены различные учреждения районного центра — почта, отделение госбанка, склады организаций по заготовке льна и зерна.

Богослужения в храмах уже упразднённого монастыря продолжались до октября 1928 года. 8 ноября 1928 года в помещениях бывшего монастыря был открыт краеведческий музей — филиал Ростовского музея-заповедника. В 1954 году эта организация была упразднена, но уже в 1961 году он снова возродился, уже как «народный музей». Позднее он вновь становится филиалом Ростовского музея-заповедника.

С 1994 года музей делил помещения с возрождённым монастырём вплоть до 2015 года, когда последнему было возвращено всё имущество. Здания монастыря как составляющие значительный памятник истории и культуры находятся под охраной государства.

В Борисоглебском монастыре хранился восьмиконечный деревянный крест, которым, по преданию, преподобный Сергий благословил основателей обители, в настоящее время в собрании Борисоглебского музея. Крест обит тонким листом золоченого серебра, оклад сделан, вероятно, в первой четверти XV века.

В обители почитался список с Лиддской (Римской) иконы Божией Матери, привезённый в Борисоглебский монастырь из Москвы 9 февраля 1588 года строителем Варлаамом, с 1954 года икона находится в Ростовском музее. В 2001 году был выполнен список с иконы и передан в Борисоглебский монастырь.

Другая реликвия монастыря — «охранное знамя Сапеги». Знамя выполнено в форме хоругви, на нём изображены архангел Михаил, охраняющий врата рая, и Иисус Навин. По легенде, это знамя Ян Сапега захватил в одном из сражений с русскими войсками, более вероятно, что это произведение годуновской школы шитья происходит из суздальского Покровского монастыря, разграбленного поляками. Спасаясь после поражения от русских войск под Калязином, Сапега остановился лагерем у Борисоглебского монастыря и оставил знамя в обители.